在凈化車間的工作中，工作人員應消毒雙手并戴手套以防止污染。口鼻內存在大量的病毒、細菌和顆粒物，因此，在凈化車間內應盡量避免喊叫或者高聲說話，盡量地避免咳嗽和打噴嚏，以免影響工作成品率。
在正常情況下，工作人員應定期洗澡和洗頭并保持個人衛生。在進入凈化車間之前，應徹底清潔。尤其應該注意指甲和指甲根部。在日常的工作過程中，應當對這些注意事項要做特別了解，并且在工作中按照相關的操作流程來行事，這樣才能保證生產環境的整潔，才能保證菌種菌棒生產的順利進行。
室內回風混合點C處空氣經組合式空調表冷器段熱溫處理到露點L，由凈化車間系統的送風溫差和室內熱濕比線確定送風狀態點O，露點L處的空氣經再熱器再熱處理到送風狀態點O，并沿熱濕比線送進室內。
凈化車間對室內含塵濃度控制的同時，要求對室內溫濕度進行全面控制。一般潔凈廠房室內計算溫度為23℃，相對濕度55％，此時空氣露點溫度為13.5℃。空調熱混負荷的任務可以看作是從23℃的環境中向外排熱，在13.5℃露點溫度的環境下向外排濕，考慮到傳熱溫差，采用5℃冷媒對混空氣冷凍除濕。
而這種低溫冷媒冷凍除降溫段和混空氣等濕再熱段無疑造成能源品位上的浪費。另外，醫藥食品行業的某些凈化車間有低濕要求。當凈化車間中，相對混度低于40％時，由于送風狀態點露點溫度過低，5℃冷媒已不能滿足除溫要求，需采用其他除濕方式輔助解決。
傳統方案系統表冷器制冷量為42.12kw再熱器制熱量14.55kw。優化方案系統后的干盤管制冷量8.59 kw，另有150m3h風量的真空泵，根據新亞公司資料，所選型真空泵功率12w，耗能極低。對比結果可發現優化方案表冷器制冷量降低了79.61％，且省去再熱能耗。
由于膜法除濕機價格昂貴，凈化車間中的優化方案初投資較高，適用于大中型系統或除混量較大的系統。不同行業的凈化工程規范要求不同，某些工藝房間需要有排風。當系統新風比發生變化時根據熱濕處理后新風的露點溫度及干球溫度調整干盤管冷媒溫度，以保持系統承擔足夠的冷量。