醫用凈化工程可防止外源性感染，是現代醫院的標配，世界衛生組織把一般可以接受的細菌數定位為＜500cfu/m3，把低污染的細菌數定位為200cfu/m3，把最低污染的細菌數定位為10cfu/m3，然而，現在醫院場所的空氣環境與最基本的衛生要求相差很大。
空氣凈化是阻隔式過濾器+氣流組織+壓差梯度，是醫院解決受控環境潔凈問題重要的技術手段。各國統計數據表明，空氣潔凈技術與裝備控制污染作用明顯。采用空氣潔凈技術的范圍一般包括凈化工程、重癥監護病房、血液病病房、特殊功能實驗室、靜脈用藥配置中心、生殖醫學中心等受控環境最核心的部分。潔凈手術用房投資占比高，技術含量高，建成之后改造困難，因此其前期設計方案論證、施工管理、運維管理等各項工作非常重要。
運維管理：標準化管理，提高工勤人員技術水平即使醫院潔凈空調系統的設計與施工都很完善，如果沒有科學的運行管理制度及認真負責的運行管理人員，室內的空氣狀態參數也不可能達到預期的效果，給醫院凈化工程造成不必要的損失。為此，凈化工程必須依照國家有關規定科學制訂一套嚴格的運行管理體系。
《醫院空氣凈化管理規范》WS/T368—2012提供了空氣凈化管理的基本標準，可以依據標準做好各專業的分工協作，落實管理責任。
規范要求設備的清潔、維護、保養必須依照說明書進行，做好檢查和記錄。凈化工程中管理人員應根據工勤人員情況定期進行技術培訓，使他們熟悉有關的維護技術流程和標準要求，工勤人員要有過硬的技術，才能最低限度減少對使用的影響。
規范對空氣過濾系統管理有了更為詳盡的論述，對使用期限有推薦值，實際凈化工程中結合過濾器廠家要求，設定使用時間區間，及時更換過濾器，避免出現過濾器失效的情況。
醫院應每季度對感染高風險部門進行監測；凈化工程及其他潔凈場所在新建與改建驗收時以及更換高效過濾器后應進行監測；遇醫院感染暴發與空氣污染有關時隨時進行監測，并進行相應致病微生物的檢測。
醫院應對全院有關科室的空氣質量進行檢查和指導，實際凈化工程的工作中，建議潔凈空調參數的監測部分如風速、壓差、溫濕度、粒子數、照度、噪音等由后勤設備管理部門做經常性監測，監督物業公司的工作質量以及過濾器供應商的產品質量。各類空氣、物品表面菌落數指標的監測宜由院感部門負責。各項培訓可以結合分工進行。
同時，《醫院消毒衛生標準》GB 15982-2010規定，凈化車間的設計、驗收參照《醫院凈化工程建設技術規范》GB 50333要求，竣工全性能監測應由有資質的第三方單位完成。建議凈化工程的使用效果監測每年也能夠由有資質的第三方進行。只有有科學的使用、監測、維護，才能使凈化工程處于良好工作狀態。醫用凈化工程作為醫院核心受控環境區域，在設計、施工、運維方面都要對關鍵要素進行有效管理，這樣才能做出高品質的工程。