由于冷凝水的產生和積累，空調單元很容易成為細菌滋生的場所，因此應重新分配系統的熱量和濕度負荷，盡量減少系統中施工況運行點。門診凈化工程采用循環凈化空調機組干工況運行系統。系統濕負荷全部由新風機組承擔，冷負荷由新風機組和各循環空調機組共同承擔。
1.空氣處理方案
門診凈化工程系統具有以下運行特點：
(1) 對新鮮空氣進行集中處理，并通過粗，中，亞高效三個階段進行過濾，以滿足進一步凈化處理的要求，有利于保證門診室的潔凈度和改善末端高效過濾器的工況。
(2)循環機組承擔了部分冷負荷，減輕了新風的負擔。
(3) 經過深層處理的新鮮空氣可以抵消室內的濕度，并且不需要對循環單元進行除濕，因此單元盤管傾向于在干燥條件下運行。
(4)濕度通過新鮮空氣裝置機器的露點溫度進行調節，然后通過回風量進行微調，而無需重新加熱，避免了傳統恒溫恒濕處理方式中大量冷熱量的抵消，使門診凈化工程系統的整體能耗大為降低。
(5)新風機組可作系統值班機組使用，維持潔凈門診室的常年正壓工況。
(6)各房間送風量便于獨立控制和關斷。
2.負荷計算
以醫院門診凈化工程的一間門診室為例，體現計算方法。
門診區上部采用潔凈頂棚供氣，可將周圍環境減少一級清潔度，達到使用效果，節約能源，減少能耗。門診室采用上送下回的層流氣流組織形式，萬級門診室采用上送下回的低紊流氣流組織形式，符合相應級別門診室的要求，使門診臺及周邊工作區籠罩在潔凈氣流形成的主流場內。
無影燈選擇氣流阻塞系數小的流線型無影燈，可以減少氣流阻塞對門診凈化工程工作區域上方空氣供應的影響，三級過濾是一個系統概念，合理采用過濾器和配置系統，能以合理的運行費用達到標準要求。
壓力梯度和定向氣流可以防止外部污染空氣的侵入以及低空環境對高空的影響。排風系統設在病人頭側有利于廢氣排放；防倒灌措施可避免外部污染空氣侵入。康德萊凈化了解到，排風機與門連鎖，并采用變頻和延時措施，有利于保持室內正壓，避免頻繁無謂的啟停。門診凈化工程的負荷特點是室內熱濕比變動較大，這是一些門診室相對濕度超標的主要原因。