在手術室凈化系統當中，高效過濾器是一種消耗材料，如果想要確保潔凈的效果，通常每隔一段時間就得更換，現在大多數手術室凈化區都在頂棚送風口安裝高效過濾器。安裝方法和安裝前的確認完全決定了高效過濾器是否有漏點。而安裝前的確認更為高效安裝時提供了有效的客觀條件，所以康德萊凈化認為在安裝時必須注意以下這些問題：
1、在運送以及存放高效過濾器的過程中，一定要按照生產廠家所標明的方向進行放置。而且在運輸過程中應輕拿輕放，防止劇烈振動和碰撞，以免造成人為的損壞。
2、在安裝之前，一定要對潔凈室進行清潔，空調凈化系統的內部如果有積塵的話，就需要再次清掃、擦拭，達到清潔要求。如在手術室凈化技術夾層或吊頂內安裝高效過濾器，則技術夾層或吊頂內也應進行全面清掃、擦拭。
3、另外，過濾器安裝的時候，一定要在安裝的現場打開包裝檢查外觀，檢查的內容有：濾紙、密封膠和框架有無毛刺和銹斑(金屬框)，有無產品合格證，技術性能是否符合設計要求，然后進行撿漏，經檢查和撿漏合格的應立即安裝。安裝時應根據各臺過濾器的阻力大小進行合理調配，對于單向流，同一風口或送風面上的各過濾器之間，每臺額定阻力和各臺平均阻力相差應小于5%。
4、過濾器跟框架間的密封可以使用的方式比較多，一般根據具體情況來實現，不過使用密封墊、不干膠、負壓密封、液槽密封和雙環密封等方法時，都必須把填料表面、過濾器邊框表面和框架表面及液槽擦拭干凈。密封墊的厚度不宜超過8mm，壓縮率為25%~30%。其接頭形式和材質應符合手術室凈化設計要求，框架各接縫處不得有滲漏現象。采用雙環密封條時，粘貼密封時不要把環腔上的孔眼堵住;雙環密封和負壓密封都必須保持負壓管道暢通。
從現在的大部分情況來看，手術室凈化工程在安裝過濾器的時候往往會使用的都是密封墊法，因為海綿橡膠板是閉孔型的，具有良好的氣密性，所以一般用它作為作密封材料。如有必要，建議最好在密封條上均勻的打上點玻璃膠。把過濾器和靜壓箱連接上時，四周受力要均勻。待24小時后，玻璃膠干了再運行手術室凈化系統。